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厲害了|小麥大規模外顯子測序

已有 676 次閱讀 2019-4-29 09:19 |系統分類:科研筆記| 小麥, 外顯子組測序, 基因組

厲害了|小麥大規模外顯子測序

今天給大家簡單介紹一個將要在nature genetic 發表的小麥外顯子測序的文章(小道消息)。
某天胖丫,查看NCBI上更新的SRA數據,發現新增了不少小麥方面的數據,其中就有今天我們要介紹的這個項目。

根據上圖提供的網站信息(http://wheatgenomics.plantpath.ksu.edu/1000EC/)
點開進入網站,發現該項目竟然對多達1000份小麥材料進行了外顯子測序。


而且文章即將在NG發表。

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如果只是這些消息,當然不值得和大家分享。更具有吸引力的是,數據已經提前釋放。

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沒有一絲猶豫,我們就將數據下載下來了。
隨后,也將數據放到我們網站上了(http://202.194.139.32/jbrowse-1.12.3-release/?data=Chinese_Spring)。

材料信息

趕緊查閱感興趣的的基因吧。

目前,網站上收集了眾多材料的分型數據,目測有1600份了吧。有這些信息,就可以了解你感興趣的區段或基因在群體中的基因型,結合手頭的群體就可以做些有趣的分析了。

參考文獻:
He F., Pasam R., Shi F., Kant S., Keeble-Gagnere G., Kay P., Forrest K., Fritz A., Hucl P., Wiebe K., Knox R., Cuthbert R., Pozniak C., Akhunova A., Morrell P.L., Davies J., Webb S., Spangenberg G., Hayes B., Daetwyler H., Tibbits J., Hayden M., Akhunov E., Exome sequencing highlights the role of wild relative introgression in shaping the adaptive landscape of the wheat genome. Nature Genetics (in press)

此消息,在十幾天前就在我的朋友圈公布了。歡迎掃描下方二維碼圍觀我的朋友圈,了解小麥研究相關的最新進展。

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http://www.ueservicedoffices.com/blog-1094241-1176093.html

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